Patriarcha Nikonův drahocenný sen, který vedl ruskou pravoslavnou církev v letech 1652 až 1666, byl obnovením komplexu svatých míst Palestiny poblíž Moskvy. Začal to realizovat v roce 1656 a založil klášter na břehu řeky Istra, který později obdržel jméno svatého vzkříšení nového kláštera v Jeruzalémě. Ve své hlavní katedrále byly reprodukovány obrazy, jako by pocházely ze stránek evangelia: Mount Calvary a jeskyně Božího hrobu, která se stala pohřebištěm a následným vzkříšením Ježíše Krista. Podle plánu nejsvětějšího museli pravoslavní lidé uvažovat svým vlastním pohledem místo, kde jim Spasitel učinil pro ně smírnou oběť.
Historici poukazují na to, že patriarcha Nikonová nebyla první, kdo přišel s myšlenkou přenést obraz Pánova chrámu a jeho svatyní do ruské země. Existuje řada památek, které odrážely vliv Jeruzalémského "prototypu". Mezi nejvýraznější patří Kostel přímluvy na příkopě a plán, který plánoval Boris Godunov, který nikdy nebyl proveden k vytvoření náboženského komplexu "svatých svatých" v Moskvě, jehož prototyp měl sloužit pravým místům Kristových vášní.
Myšlenka však byla ztělesněná vytvořením nového vzkříšení nového kláštera v Jeruzalémě, který se stal oblíbeným dítětem patriarchy Nikon. V jeho hradbách strávil nejsvětí osm let po svém odchodu z hlavního města a v srpnu 1681 zemřel na cestě k němu a vrátil se z exilu, který sloužil v klášteře Cyril-Belozerský.
Stavba kláštera začala v roce 1656, ještě předtím, než patriarcha Nikon vznesla hněv suverénního Alexeja Mikhailoviča. S využitím královské dispozice se mu podařilo získat pozemky pro budoucí stavby, které byly dříve majetkové a byly předány výlučně dědictvím. Byly umístěny 60 verstů (asi 64 km) od hlavního města na břehu řeky Istra.
Po evidenci všech dokladů o vlastnictví pozemků prošel vybraný prostor důkladnou přestavbou. Les byl zřízen a kopce, která se stala místem budoucího kláštera, byla naplněna a důkladně posílena. Od této chvíle se stal známým jako Sion a další dvě nedaleké vysočiny - Favor a Eleon. Dokonce i řeka Istra byla přejmenována, kterou patriarcha nařídil zavolat Jordánu.
V roce 1662 se na jeho břehu objevil první skit, ve kterém byly vystavěny dva malé kostely: Epifany a Petra a Pavla. Současně byl založen malý klášter, který získal neméně bláznivé biblické jméno "Bethany".
Vzhledem k tomu, že stavba nového kláštera v Jeruzalémě byla velikým technickým úkolem, vyžadovalo velké množství práce, které zahrnovalo jak pomocné pracovníky, tak i kvalifikované řemeslníky. Z tohoto důvodu byli mnozí mnichoví a patrimonští rolníci vedeni k břehům Istra z různých okresů moskevského regionu. To způsobilo jejich extrémní nespokojenost, protože když byli odděleni od domova, ztratili příležitost zapojit se do své vlastní ekonomiky a odsoudili své rodiny k hladovění.
Jak se to stalo v dějinách většiny klášterů, výstavba nového kláštera v Jeruzalémě vzkřísila vzhled dřevěných konstrukcí vyrobených v tradičním stylu ruské architektury. Za účasti patriarchy Nikona vznikl celý komplex takových struktur, jejichž středem byl kostel vzkříšení.
Na svém zasvěcení, který se konal v říjnu 1657, se zúčastnil panovník Alexey Mikhailovič, který poprvé volal klášter, postavil 60 veršů z Moskvy v Novém Jeruzalémě. Svojí lehkou rukou tato fráze uvízla a po obdržení oficiálního statusu přežila až do dnešních dnů. Pod záštitou panovníka se v krátké době stal velkým majitelem půdy. V různých ruských oblastech, dokonce i těch, které se nacházejí v značné vzdálenosti, byly pro něj získány patrimonial statky spolu se svými poddanými rolníky.
Katedrála vzkříšení nového kláštera v Jeruzalémě, která přežila dodnes a je hlavní budovou celého architektonického komplexu, byla založena v září roku 1658. Svou smrtící souhrou okolností, současně iniciátor samotné stavby, patriarcha Nikon, padl do imperiální hanby a byl z hlavního města odstraněn. Nicméně, pod povolením monarchy, měl během příštích osmi let možnost zůstat ve stěnách kláštera a osobně dohlížet na veškerou práci.
Toto pokračovalo až do roku 1666, kdy se na základě rozhodnutí církevního soudu vyvražděný patriarcha vyhnal z kněžství a poslal jako jednoduchý mnich-chernets do Ferapontova a pak k klášteře Kirillo-Belozersky. S jeho odchodem byla veškerá práce v ještě nedokončeném Znovuzřízení Nového Jeruzalémského kláštera zastavena a obnovena až po smrti panovníka a vzestupu na trůn jeho dědice, mladého cara Fedora Aleksejeviče.
Jak bylo zmíněno výše, v roce 1681 se 76letý Nikon, bývalý patriarcha a tehdejší obyčejný mnišský kadeř, vrátil z exilu a zamířil k Istra, a oni zemřeli poblíž Jaroslavl. Jeho tělo však bylo dodáno do kláštera a podle vůle bylo pohřbeno v jižní boční kapli chrámu.
Po smrti Nikona pokračoval stavba kostela vzkříšení nového kláštera Jeruzalém a v lednu 1685 se konalo jeho slavnostní vysvěcení. Tentokrát se otěže ruského státu dostaly do rukou princezny Sophie. Při návštěvě kláštera jako čestného hosta osobně uvedla místo pro stavbu další svatyně - Církev narození, postavené v roce 1692.
Roky Petra Velkého byly těžké období života většiny ruských klášterů. Problémy nového kláštera v Jeruzalémě nebyly ušetřeny. Počet bratří se snížil a pro jeho údržbu byly propuštěny velmi omezené prostředky, zatímco většina jejich vlastních příjmů šla do pokladny. Kromě toho byli Boží lidé povinni dodat koně a krmiva pro armádu a v případě potřeby i nábor.
Poněkud volnější, mnichi si povzdechli, když císařovna Elizaveta Petrovna vystoupila na ruský trůn. Kvůli tomu, že císařovna za její ochranu zachránila klášter, jí přidělila 30 tisíc rublů - obrovskou částku za tyto časy - dokázala opravit budovy, které se začaly zhoršovat, a také obnovit střechu rotundy, která se zhroutila v roce 1723. Existuje názor, že během období těchto prací byl styl křesťanského zmrtvýchvstání nového Jeruzalémského kláštera částečně změněn, na který stavitelé zradili rysy moskevského baroka, které byly v té době módní. Jako charakteristický rys té doby lze také připomenout snížení daní placených státu, což umožnilo výrazně zlepšit výživu obyvatel.
Nicméně, pozemská pohoda mnichů se ukázala jako krátkodobá a při příchodu císařovny Kateřiny II k moci byla opět nahrazena obdobím protivenství. Začali slavným Manifestem z 26. února (8. března) z roku 1764, podle kterého většina klášterních zemí podléhala sekularizaci, tedy zabavení ve prospěch státu. Období hmotného úpadku většiny ruských klášterů začalo.
Z dějin vzkříšení nového kláštera v Jeruzalémě je známo, že na počátku 60. let 18. století vlastnil 22 tisíc dessiatin zemského, na kterém žilo asi 14 tisíc rolníků. Po vstupu Manifestu v platnost bylo toto bohatství vybráno a pouze 30 akrů orné půdy a dvě farmy v Moskvě zůstalo v držení mnichů. V těchto obtížných obdobích byly hlavními výnosy peněžní příjmy od poutníků a soukromých darů. Pokud jde o prostředky získané od státu, jejich objem nepřesáhl 30% dřívějších dotací.
Během 19. století byl jedním z nejnavštěvovanějších středisek ruské poutě nový klášter v Jeruzalémě (Istra). Tok poutníků se stal obzvláště intenzivní poté, co pobočka železnice Moskva-Rybinsk, která kolem něj procházela, byla postavena v roce 1870. Zvýšený peněžní tok umožnil mnichům provádět řadu stavebních prací. Tak byl vybudován kamenný hotel pro bohaté poutníky a hospicový dům, kde zůstali chudí. Kromě toho byla otevřena bezplatná škola pro děti z rodin s nízkými příjmy, kde získaly základní vzdělání.
Zachoval informace, podle kterých v druhé polovině XIX. Století klášter každoročně uspořádal až 35 tisíc lidí. Tuto vysokou popularitu lze nejprve vysvětlit jedinečnou příležitostí vidět znovuobjevení svatých evanjelických lokalit, a jednak tím, že vzdálenost k novému klášteru vzkříšení Jeruzaléma, který se nacházel asi 64 km od Moskvy, mohl být snadno překonán železnicí.
Stejný obraz hmotného blaha a neustálého duchovního života byl pozorován v klášteře a na počátku 20. století. Bylo to jen hotové přichází k moci bolševikům. Již v roce 1919 byl řádem Rady lidových komisařů uzavřen klášter a jeho prostory byly zvyklé na vytvoření dvou muzeí, z nichž jedna byla věnována dějinám regionu a druhá měla čistě umělecký směr. Po čase se tyto dvě kulturní centra spojily a Státní muzeum umění a historie přežilo až dodnes. Neexistoval žádný nedostatek exponátů pro něj.
Návštěvníci si mohli prohlédnout rozsáhlou sbírku církevních nádob, která byla zachycena "novými mistry života" z klášterních kostelů, které se zde nacházejí, kostýmní sakristie a také z dříve existujícího pamětního muzea věnované památce toho, kdo založil novoroční klášter znovuzřízeného Jeruzaléma. Významné místo na výstavě bylo kromě toho věnováno uměleckým dělám obsazeným z bohaté šlechty a obchodních sídel moskevské provincie.
Naneštěstí některé z exponátů nepřežily až do současnosti, protože během Velké vlastenecké války bylo území okupačního území v bývalém klášteře a nacisté, kteří vybuchli katedrále vzkříšení, zničili mnoho památkových objektů, které jsou v ní uloženy. Je známo, že materiály, které svědčí o tomto barbarství, byly ohlášeny během Norimberský proces.
V prvních poválečných letech, kdy celá země vyléčila zranění minulých let, začalo plánované obnovení zničeného muzejního komplexu ve městě Istra, ale množství práce bylo tak velké, že byly dokončeny teprve v roce 1959. V té době nebylo možné znovu oživit pouze hlavní architektonickou dominantu, která byla kdysi proslavena novým klášterem znovuzrození Jeruzalém - mnohostěnnou zvonicí XVII. Století.
Oživení kláštera v jeho původním účelu začalo v roce 1993 se skutečností, že patriarcha Alexy II. Pověřil svého zástupce Archimandrije Nikity (Latushko), aby jednal s vedením Istrinskyho okresu v Moskvě a správou muzea o předání dříve vlastněného kláštera do církve její budovy. Okamžik pro to byl vybrán velmi štěstí, protože v důsledku perestrojky se v celé zemi rozběhlo hnutí, aby se věřící vrátili z nemovitosti nezákonně.
Jednání a vykonávání příslušných dokumentů netrvalo dlouho a v příštím roce začal duchovní život uvnitř zdí starého kláštera pokračovat. Od prvních dnů získal oživený klášter status stavpegie, tedy nezávislý na diecézních úřadech a podřízený přímo patriarchovi. V červenci téhož roku se uskutečnilo setkání Svaté synody, v němž bylo rozhodnuto jmenovat archimandriti Nikita, který udělal tolik za návrat své svatyně lidu, jako vedoucího nového kláštera v Jeruzalémě.
V současné době se ve městě Istra v oblasti Moskvy spolu s oživeným klášterem nachází Muzeum dějin a umění. Ve své sbírce je téměř 180 tisíc exponátů, pro které byla vybudována pohodlná moderní budova. Takto starověké ruské město Istra může být správně nazýváno centrem náboženského, kulturního a vzdělávacího života.